纲手绳树和加藤断先后死去之后便患上了【恐血症】，然后便离开了木叶，混迹于某场所，成为【传说中的大肥羊】。
重现木遁的实验在木叶高层的默许下展开，却又因为某些原因无疾而终，大蛇丸也因此有了所谓的【黑点】，与火影之位渐行渐远。在三战之后，大蛇丸便与志村团藏确立全面合作，但是大蛇丸也知晓志村团藏的尿性，因此便先一步地在东大陆忍界各地建立据点。
就在此时，大蛇丸本尊进入《帝望》，把即将叛逃的大蛇丸给拉进了千眼组织当中，于是大蛇丸便果断地销毁了所有证据，离开了木叶。只是大蛇丸虽然已经选择离开木叶，志村团藏却没有打算放过他，暗中提供了各项证据，使大蛇丸依旧没有逃过成为叛忍的命运。
（正常来说，大蛇丸应该在四代目逝世以后不久就被志村团藏给出卖，然后叛逃。但因为御魂商团、千眼组织以及玩家们的影响下，这个时间点被向后推延了，所以大蛇丸的命运才会出现这样的偏折。）
在逼迫猿飞日斩退位以前，最有资格继任的只有被称为【木叶白牙】的旗木朔茂，以及三忍之一的大蛇丸，只不过大蛇丸在志村团藏的发挥下有了黑点存在，所以在志村团藏认为唯一有可能与他争夺火影之位的，也就旗木朔茂一人而已。
因此，志村团藏设计陷害，并利用舆论对旗木朔茂进行伤害，再透过各种方式将其孤立，最终成功地使其心生死志，然后自裁逝世。
在大蛇丸成为所谓的叛忍以后，因为所有证据都是志村团藏所提供的，不管是猿飞日斩还是在来也，其实都心存疑窦，深深地怀疑这是不是志村团藏的手笔，于是在猿飞日斩的默许下，自来也踏上了追寻大蛇丸的旅程。
至于四代目火影波风水门的部份，这边就不再次赘述了。
《帝望》日天帝国东大陆忍界的历史发展轨迹虽然与原本的轨迹相仿，可细节之处却是多有不同，但不管怎么说，木叶忍村当前的高端战力几近沦丧，却是不争的事实。
猿飞日斩沉默了片刻，却开口问道：〝可是事到如今，我们难不成还能把千眼组织往外推？〞
〝既然千眼组织的兑阁下已然前来，本身就是对我们木叶的一种认可，要是这时候拒绝了千眼组织的要求，便会突显出我们的虚弱和没有底气。〞就在猿飞日斩发问之际，外交一把手的转寝小春便立刻给出了答案。
各大忍村其实都有着自己的眼线和间谍存在，想要知道其它忍村所发生的事情，只要不是太过于机密的情报，真心不是一件什么难事，差别只在于要花多久时间而已。
一但木叶显露出底气不足的模样，各大忍村很快地便会心生异念，然后卷土重来，对火之国发起攻势，这几乎是必然的结果。
在场的木叶高层脸色一沉，他们自然能够明白其中的险恶之处，但是眼前的状况却没有给他们太多的选择余地。猿飞日斩找他们来商议，与其说是在讨论要不要接受千眼组织的请求，还不如说是找他们来商议该怎么搞好这一次的中忍考试和拍卖会，并防止其它忍村发现木叶此时外强中干的本质。
众人沉默了许久，猿飞日斩却是第一个开口说道：〝我决定动员日向一族和宇智波一族的人手。〞
转寝小春和水户门炎闻言不禁皱起了眉头，但是他们也不得不承认，这是当前唯一的破局方法。
可是不待他们两人提出他们的意见，志村团藏却是直接炸了！
〝日斩！我不同意！尤其是动用宇智波一族的部份。〞志村团藏直接站了起来，然后一脸愤怒地说道：〝日斩，难道你忘了二代大人的意志了吗？宇智波一族根本就是罪恶一族！一但这么做，我们这么多年的努力也就白费了，你知道吗？若再凭着三战时的功绩，我们之后还怎么阻止他们成为木叶的高层？你这是打算毁了整个木叶？〞
〝团藏，可是你不要忘了，哪怕如智波一族真是罪恶一族，也还是存在着火之意志的继承者！镜就是最好的一个例子，不是吗？还是说……你连镜都不承认？〞猿飞日斩说到最后，语气也渐渐地变得严厉与不善。
一提到宇智波镜，转寝小春和水户门的脸色便不由得放缓，而志村团藏的眼眸虽闪过了一抹愧疚的神色，可是他随即便又坚定了自己的信念：〝谁说我不承认镜是火之意志的继承者？可是镜是镜，宇智波一族是宇智波一族，日斩你不要混淆其中的概念。〞
〝镜难道不是宇智波一族的人吗？团藏，倘若宇智波一族还有着更多像镜一样的存在，我并不介意让他们进入暗部，甚至是成为木叶的顾问。〞猿飞日斩若有所指地说道。
志村团藏冷哼一声，随即便重新坐了回去，然后语带嘲讽地说道：〝反正我是不同意的，至于你要做什么决定，那是你的事情，谁叫你才是木叶的火影？〞
宇智波镜，木叶忍村宇智波一族的上忍，年轻时担任第二代火影的精锐护卫部队，与猿飞日斩、志村团藏、水户门炎、转寝小春、秋道取风是队友。
他是少数不受狭隘的本族主义所束缚的人之一，富有智慧，理智，善于思考，具有强烈的火之意志，为木叶奉献了一生，也是唯一一个二代目火影信任的宇智波族人，他为木叶村的发展做出了极大的贡献，得到了二代目火影和三代目火影的高度评价。宇智波镜曾教导自己的后辈宇智波止水继承火之意志，而止水也进一步将其教导给了宇智波鼬，但这是后话，在此暂且带过。
在东大陆忍界第二次忍界战争即将结束时，云隐村内部产生了分裂，因为第二代雷影艾想停战，但手下的忍者却并不希望这样，忍者中有势力的金角银角不甘心以惨败收场，他们希望继续维持战乱状态，因此，在雷影与火影的结盟仪式上，金角银角掀起政变，二人以六道忍具的力量和九尾查克拉，让第二代雷影和第二代火影受到了濒临死亡的重伤。
此后金角银角率众云隐精英追击扉间部队，面对困境，宇智波镜提出了自己的观点。
随后扉间为了保护新兴忍者，独自一人对付能够自如操纵六道仙人的五大忍具、拥有九尾查克拉的金角银角。
经过一场大战后，第二代火影扉间为给部下争取逃脱时间力竭而牺牲，被奉为守护木叶的英雄，敌人也付出了惨痛的代价，宇智波镜也在此役为救团藏而重伤，沒几年便丧生了。
看着陷入沉默了的志村团藏，转寝小春和水户门炎也知道这件事情的基调差不多就是这样了，可是转寝小春在此时依旧还是开口问道：〝日斩，那你打算怎么安排？〞